MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 plasmid pKF147A

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013657	TGC	2	6	4	9	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013657	T	7	7	31	37	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013657	T	8	8	69	76	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013657	GTTA	2	8	85	92	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013657	TAT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013657	TA	5	10	119	128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013657	AGTTAC	2	12	136	147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013657	TGT	2	6	207	212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013657	GAG	2	6	216	221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013657	TGT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013657	TGT	2	6	249	254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013657	TGT	2	6	270	275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013657	AG	3	6	301	306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013657	TGT	2	6	335	340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013657	TGT	2	6	397	402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013657	ATT	2	6	403	408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013657	A	7	7	422	428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013657	TAA	2	6	439	444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013657	TGT	2	6	468	473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013657	TA	3	6	478	483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013657	TCTT	2	8	494	501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013657	TA	3	6	503	508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013657	GAAA	2	8	511	518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013657	ATT	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013657	A	8	8	1965	1972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013657	T	7	7	1991	1997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013657	AT	3	6	2005	2010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013657	A	7	7	2028	2034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013657	AG	3	6	2089	2094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013657	TAAG	2	8	2103	2110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013657	AATT	2	8	2119	2126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013657	CAA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013657	A	7	7	2159	2165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013657	TA	3	6	2227	2232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013657	A	6	6	2232	2237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013657	CTT	2	6	2314	2319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013657	AAT	2	6	2387	2392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013657	GAA	2	6	2434	2439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013657	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013657	GAT	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013657	TGGT	2	8	2516	2523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013657	A	6	6	2542	2547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013657	A	7	7	2592	2598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013657	ATAA	2	8	2667	2674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013657	AG	3	6	2680	2685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013657	TCC	2	6	6021	6026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_013657	T	7	7	6062	6068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013657	TCCT	2	8	6145	6152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013657	AAT	2	6	6208	6213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013657	GAAT	2	8	6243	6250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013657	GGA	2	6	6263	6268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013657	A	7	7	6316	6322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013657	A	6	6	6355	6360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013657	AGTA	2	8	6396	6403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013657	A	6	6	6420	6425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013657	ATT	2	6	6432	6437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013657	TAC	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013657	TAT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013657	GAA	3	9	6578	6586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013657	A	7	7	6707	6713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013657	AGC	2	6	6725	6730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013657	TA	3	6	6841	6846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013657	ACG	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013657	AAAT	2	8	6920	6927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013657	AT	3	6	6987	6992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013657	GAA	2	6	7003	7008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013657	TATAG	2	10	7043	7052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013657	TTAT	2	8	7091	7098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013657	TCA	2	6	7235	7240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013657	TTG	2	6	7254	7259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013657	A	6	6	7269	7274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013657	ATA	2	6	7331	7336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013657	ATG	2	6	7350	7355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013657	ATG	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013657	TA	3	6	7978	7983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013657	AAC	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013657	GTT	2	6	8043	8048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013657	ATA	2	6	8064	8069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013657	T	7	7	8125	8131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013657	T	6	6	8169	8174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013657	ATA	2	6	8294	8299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013657	A	6	6	8299	8304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013657	AT	3	6	8339	8344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013657	A	6	6	8676	8681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013657	TAT	2	6	8684	8689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013657	ATA	2	6	8704	8709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013657	AAT	2	6	8761	8766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013657	AT	3	6	8784	8789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013657	ATA	2	6	9274	9279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013657	A	10	10	9292	9301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013657	TTG	2	6	9323	9328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013657	ATT	2	6	9358	9363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013657	CAAA	2	8	9394	9401	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013657	AGT	2	6	9408	9413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013657	GAA	2	6	9421	9426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013657	CTT	2	6	9499	9504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013657	ATT	2	6	9534	9539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013657	AGT	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013657	AATT	2	8	9571	9578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013657	T	6	6	9625	9630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013657	TAT	2	6	9639	9644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013657	AG	3	6	10354	10359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013657	TAAAA	2	10	10377	10386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013657	CT	3	6	10393	10398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013657	GCTT	2	8	10466	10473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013657	AGA	2	6	10499	10504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013657	C	6	6	10541	10546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_013657	AGG	2	6	10558	10563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013657	AT	3	6	11203	11208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013657	CTTTT	2	10	11327	11336	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013657	AGGA	2	8	11381	11388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013657	AGTT	2	8	11389	11396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013657	TC	3	6	11403	11408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013657	TAA	2	6	11459	11464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013657	A	6	6	11463	11468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013657	ACA	2	6	11479	11484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013657	TTTA	2	8	11934	11941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013657	TTATT	2	10	11972	11981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013657	T	8	8	11980	11987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013657	T	6	6	11989	11994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013657	AAAAT	2	10	12062	12071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013657	TAT	2	6	12112	12117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013657	TAC	2	6	12118	12123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013657	TAA	2	6	12124	12129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013657	GAC	2	6	12182	12187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013657	CAG	2	6	12188	12193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013657	CTC	2	6	12209	12214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013657	GATCCA	2	12	12235	12246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013657	TTC	2	6	12261	12266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013657	TTA	2	6	12770	12775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013657	AAT	2	6	12784	12789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013657	CCA	2	6	12795	12800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013657	AGA	2	6	12849	12854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013657	TTCT	2	8	12857	12864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013657	TCC	2	6	13824	13829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013657	T	7	7	13830	13836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013657	TA	3	6	13839	13844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013657	TA	3	6	13854	13859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013657	TA	3	6	13882	13887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013657	AT	4	8	13954	13961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013657	TAT	2	6	13991	13996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013657	AAAT	2	8	13998	14005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013657	A	6	6	14012	14017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013657	T	6	6	14042	14047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013657	CTT	2	6	14084	14089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013657	CATTTA	2	12	14112	14123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_013657	TA	3	6	14159	14164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013657	GGA	2	6	14198	14203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013657	AATAA	2	10	14765	14774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013657	TAA	2	6	14839	14844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013657	TCA	3	9	14882	14890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013657	TATT	2	8	14948	14955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013657	CTT	2	6	15063	15068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013657	CT	3	6	15100	15105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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449	NC_013657	ATT	2	6	34419	34424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_013657	TTA	2	6	34435	34440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_013657	A	6	6	34458	34463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_013657	A	8	8	34476	34483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_013657	AAAC	2	8	34486	34493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_013657	GTTT	2	8	34507	34514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
455	NC_013657	A	6	6	36478	36483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_013657	ATA	2	6	36489	36494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_013657	TGC	2	6	36508	36513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_013657	GGT	2	6	36544	36549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
459	NC_013657	T	6	6	36618	36623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_013657	CAA	2	6	36627	36632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_013657	AAGC	2	8	36645	36652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
462	NC_013657	TTC	2	6	36730	36735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_013657	TA	3	6	36745	36750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_013657	ATTT	2	8	36811	36818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_013657	CGT	2	6	36819	36824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_013657	TA	3	6	36892	36897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_013657	GCT	2	6	37008	37013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_013657	TTTC	2	8	37025	37032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
469	NC_013657	TCT	2	6	37153	37158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_013657	ATA	2	6	37166	37171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_013657	GTA	2	6	37283	37288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
473	NC_013657	ATG	2	6	37327	37332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
474	NC_013657	CTT	2	6	37407	37412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_013657	AGA	2	6	37430	37435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
476	NC_013657	GAAA	2	8	37449	37456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
477	NC_013657	GAT	2	6	37482	37487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.